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青藏高原的快速隆升形成了大量高山和河流，顯著改變了歐亞地區的地貌和氣候。與其他生物相比，魚類更易受到影響，這是由于它們主要生活在水中。面對青藏高原的激流環境，鰋鮡魚類進化出巨大的胸鰭和更多的鰭條，形成一個吸附器官。然而，這種適應性進化的遺傳基礎尚不清楚。

中國科學院水生生物研究所研究員何舜平團隊基于鰋鮡魚類的代表物種黑斑原鮡的染色體水平基因組進行比較基因組分析，檢測到大量進化速率顯著加快的基因，特別是在涉及骨骼發育、能量代謝和低氧反應的基因中。研究發現，Hoxd12a在黑斑原鮡中發生了加速進化，在斑馬魚中進行基因敲除后發現該基因在塑造魚類的胸鰭方面發揮了重要作用（如圖）。其他具有特異氨基酸替換和正向選擇的基因包括參與低溫（TRMU）和缺氧（VHL）反應的蛋白質。功能實驗表明，黑斑原鮡TRMU等位基因比在低海拔魚類中發現的等位基因產生更多的線粒體ATP。VHL等位基因的功能分析表明，黑斑原鮡等位基因具有比低海拔魚類更低的反式激活活性。上述研究為剖析黑斑原鮡適應青藏高原極端環境的分子機制提供了證據。 

相關研究成果在線發表在SCIENCE CHINA Life Sciences上。