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近日，西北農林科技大學羊遺傳改良與生物育種團隊攜手國內外多家科研機構，在綿羊和山羊腸道微生物基因組數據庫構建及腸道粘蛋白和多糖代謝功能菌種挖掘方面取得進展，研究成果發表在Microbiome上。

研究團隊在全國范圍內的32個羊場收集了來自21個綿羊和山羊品種共計320個腸道樣本，分別構建了包含1.6億和8千萬非冗余基因的綿羊和山羊腸道微生物基因集目錄SMGC和GMGC，其數據覆蓋率高達80%。對比分析發現，山羊和綿羊腸道微生物基因集中共享了4900萬個非冗余基因和1138個菌種，研究詳細解析了綿羊和山羊后腸微生物在多糖和黏蛋白代謝通路中的功能差異，并揭示了飼養環境對山羊腸道微生物結構和功能的潛在影響。

通過Binning組裝技術，團隊構建了擁有5810個中高質量微生物基因組的數據庫，其中包括38個菌株級別的基因組和3149個物種級別的基因組，且從中識別出2661個先前未經確認的新型細菌。這一數據庫的建立使GTDB基因組數據庫的細菌多樣性提高了約9.3%。研究在綿羊腸道中鑒別出91個特異性定植的細菌，其基因組富含大量與黏蛋白代謝相關的功能基因和多糖利用位點，有力證明了綿羊特有的微生物群在代謝黏蛋白和多糖方面的強大功能潛力。

綿羊和山羊腸道微生物基因集及代謝聚糖和黏蛋白的功能特性。特異定植于綿羊的91個細菌的系統發育樹及其多糖利用位點。（課題組供圖）

相關論文信息：https://doi.org/10.1186/s40168-024-01806-z